I oktober 1941 Dr Franz Stahlecker, an Einsatzgruppen befälhavare tilldelad Östersjöregionen, rapporterade om metoder mot den judiska befolkningen i Litauen:

”För att fullgöra säkerhetspolisens uppgifter var det nödvändigt för oss att komma in i de stora städerna tillsammans med de angripande styrkorna ... En liten framåtgrupp i vars huvud jag stod själv, kom in i Kovno den 25 juni 1941.

Den första åtgärden var att fånga kommunistiska aktivister och kommunistiskt material ... Under de första timmarna efter att styrkorna kom in övertygade vi också, utan utan stora svårigheter, lokala antisemitiska element att starta pogroms mot judar.

I enlighet med order var säkerhetspolisen fast besluten att lösa den judiska frågan på alla sätt och med beslutsamhet. Men det var att föredra att säkerhetspolisen åtminstone i första hand inte öppet skulle dyka upp i den här åtgärden, eftersom de använda metoderna var utomordentligt hårda och kan ha orsakat reaktioner även i tyska kretsar. Det var önskvärt utåt att visa att de första stegen gjordes av lokalbefolkningen på eget initiativ, som en naturlig reaktion på deras underkastelse av judarna i årtionden ...

Befälhavaren för partisanerna, Klimatas, som särskilt rekryterades för denna åtgärd, lyckades organisera ett pogrom i enlighet med instruktioner som han gavs av vår framåtkoppling som aktiverades i Kovno, utan att det visade sig yttre att instruktion eller uppmuntran hade givits av tyskarna.

Under den första natten av pogrom, mellan 25 och 26 juni, likviderade de litauiska partisanerna 1,500 judar, många synagogor brändes eller förstördes och ett judiskt kvarter med cirka 60 hus brändes. Den följande natten dödades 2,300 judar på liknande sätt. ”